ضمن محور تعزيز الشراكات العلمية والبحثية، وقعت جامعة الزهراء للبنات عددٍ من اتفاقيات التعاون مع مجموعة من الجامعات العربية، شملت الجامعة الدولية للعلوم والتكنولوجيا في الكويت، وجامعة كسلا السودانية، وجامعة تونس المنار، وجامعة القضارف في السودان، وجامعة شرق كردفان، بالإضافة إلى جامعتي زنتان وصبراتة في ليبيا.   كما أعلنت جامعة الشارقة خلال المؤتمر عن استعدادها لتوقيع اتفاقية تعاون علمي وأكاديمي وثقافي مع الجامعة، علماً أنها ستكون الراعي الرسمي للدورة الثامنة والخمسين للمؤتمر، والمقرر عقدها في دولة الإمارات العربية المتحدة.   وأكد المؤتمر خلال جلساته على أهمية مواصلة دعم الجامعات الفلسطينية، حيث وقعت جامعة الزهراء اتفاقيتي تعاون مع جامعة فلسطين والكلية الذكية للعلوم الحديثة في دولة فلسطين، بهدف تطوير القدرات الأكاديمية وتعزيز جودة التعليم. كما أعربت عدة جامعات عربية أخرى، ومنها جامعة طرابلس الليبية، عن رغبتها في فتح آفاق تعاونات علمية وثقافية مع الجامعة، ومن خلال تبادل الزيارات والخبرات الأكاديمية بما يسهم في الارتقاء بمستوى الأداء الجامعي المشترك.   وتهدف هذه التعاونات إلى تبادل الخبرات البحثية وتنظيم الزيارات والمشاركات في الورش والدورات التدريبية، بالإضافة إلى استقطاب الطالبات ضمن مشروع (ادرس في العراق)، والذي أطلقته وزارة التعليم العالي والبحث العلمي ليسهم في تعزيز مكانة الجامعات العراقية إقليمياً وعالمياً.